●1965年，中国“三线”建设时期，公司前身西南合成制药厂在重庆市渝北区洛碛镇建立。

●1987年，磺胺二甲基嘧啶、甲氧苄胺嘧啶、磺胺甲恶唑等三个产品通过美国FDA检查，成为出口美国及欧共体等国的免检产品。

●1990年，随着三峡工程启动，西南合成制药厂实施三峡淹没技改搬迁，新厂址位于重庆市江北区寸滩黑石子。

●1993年4月，经重庆市体改委[1993]91号文批准，设立西南合成制药股份有限公司。

●1996年，磺胺二甲嘧啶、磺胺嘧啶在欧共体药典委员会获准通过。

●1996年，西南合成制药股份有限公司被列为国家医药重点骨干企业。

●1997年，经中国证监会批准，公司发行4500万A股，并在深圳证券交易所挂牌交易。

●2003年12月，北大方正集团以通过对重庆西南合成制药有限公司增资扩股的形式，成功实现重组。

●2004年，全部产品通过GMP认证。

●2008年，获重庆市重点支持的出口畅销品牌企业。

●2008年，西南合成制药股份有限公司技术中心成为国家认定的技术中心。

●2009年6月，实施定向增发，大新药业优质资产注入西南合成，实现强强联合，壮大实力。

●2009年，12个产品通过美国FDA认证（包括大新药业）：磺胺嘧啶、磺胺甲恶唑、甲氧苄啶、磺胺二甲嘧啶、磺胺二甲嘧啶钠，萘丁美酮、盐酸美克洛嗪、霉酚酸、妥布霉素、硫酸阿米卡星、阿米卡星、洛伐他汀。

●2009年10月，公司更名为北大医疗产业集团西南合成制药股份有限公司。

●2010年7月，位于重庆市两江新区，按国际高标准cGMP建设的北大医疗产业集团重庆医药制造基地开工建设，西南合成医药制造将迁移至新基地。

●2010年，累计共7个产品获得欧盟EDQM证书（包括大新药业）：磺胺嘧啶、磺胺甲恶唑、甲氧苄啶、磺胺二甲嘧啶、氢氯噻嗪、妥布霉素、妥布霉素晶型I。　

●2011年9月，实施第二次定向增发，北京北医医药优质资产注入西南合成，打通制造与流通环节，实现从原有的医药制造业延伸至医药流通领域。

●2012年，重庆医药制造基地一期工程竣工，进入调试，试运行阶段。

●2012年，公司跃居中国医药行业品牌竞争力前50强。

●2012年，公司列入重庆市推进新型工业化重点企业。

●2013年1月，公司一类抗癌新药进入Ⅱ、Ⅲ期临床研究。

●2013年11月，公司更名为北大医药股份有限公司。